Trung tâm lưu ký chứng khoán (Central securities depository/CSD) là một thiết chế cơ sở thị trường tài chính chuyên biệt để nắm giữ, đăng ký, quản lý các loại chứng khoán như cổ phiếu, các dạng có chứng chỉ hoặc không có chứng chỉ (phi vật chất hóa), cho phép chuyển nhượng quyền sở hữu dễ dàng thông qua bút toán sổ sách thay vì chuyển nhượng chứng chỉ thực thể trực tiếp. Điều này cho phép các công ty môi giới và các công ty tài chính nắm giữ chứng khoán tại một địa điểm mà chúng có thể sẵn sàng để bù trừ và thanh toán. Việc này thường được thực hiện trên nền tảng điện tử, giúp việc này nhanh hơn và dễ dàng hơn nhiều so với trường hợp thông thường là phải trao đổi chứng chỉ thực thể (trực tiếp, hiện hữu) sau khi giao dịch chứng khoán hoàn tất. Trong một số trường hợp, các tổ chức này cũng thực hiện so sánh tập trung và xử lý giao dịch như bù trừ và thanh toán chuyển nhượng chứng khoán, thế chấp chứng khoán và đóng băng chứng khoán. Trong thị trường nợ doanh nghiệp ngày nay, các nhà đầu tư đạt được cơ chế nợ thế chấp thông qua CSD. Các CSD hoạt động như bên ủy thác cho chủ sở hữu chứng khoán, theo đó tài sản thế chấp được lưu trữ và tự động chuyển (bù trừ) cho bên cho vay trong trường hợp không thực hiện nghĩa vụ. Tuy nhiên, vẫn có những rủi ro và trách nhiệm liên quan đến các dịch vụ này trong những giao dịch cụ thể cần phải được cân nhắc khi phân tích và đánh giá từng thị trường theo từng trường hợp cụ thể.
Lưu ký chứng khoán là việc lưu giữ, bảo quản chứng khoán của khách hàng cả chứng khoán vật thể và chứng khoán ghi sổ. Đồng thời đối với các chứng chỉ vật thể hữu hình thì còn phải thực hiện cả việc quản lý nhập, xuất và bảo quản an toàn chứng chỉ chứng khoán tại kho chứng chỉ chứng khoán. Khi giao dịch chứng khoán đã được xác nhận thực hiện, việc chuyển giao chứng khoán và thanh toán tiền sẽ được thực hiện bằng hình thức chuyển khoản trên các tài khoản chứng khoán và tiền thông qua các bút toán ghi sổ, thay vì chuyển giao vật chất trực tiếp như trong hình thức giao dịch tự phát. Để theo dõi và quản lý luồng ra vào chứng khoán của khách hàng ký gửi tại các trung tâm lưu ký chứng khoán (ký gửi thông qua các tổ chức lưu ký thành viên) thì các trung tâm phải thực hiện mở tài khoản lưu ký chứng khoán cho các tổ chức lưu ký thành viên và cho khách hàng (tương tự như việc mở tài khoản vãng lai để quản lý luồng tiền) nên lưu ký chứng khoán còn bao gồm cả việc thực hiện các dịch vụ liên quan đến mở tài khoản, nhận gửi, rút, chuyển khoản chứng khoán lưu ký, các tổ chức lưu ký còn cung ứng bất cứ dịch vụ được phép khác liên quan đến tài khoản lưu ký chứng khoán như dịch vụ làm trung gian trong các giao dịch bảo đảm như cầm cố, giải tỏa cầm cố chứng khoán. Đăng ký và lưu ký chứng khoán là khâu hỗ trợ trước giao dịch chứng khoán, thì bù trừ chứng khoán và tiền là khâu hỗ trợ sau giao dịch chứng khoán. Sau khi chứng khoán niêm yết đã được đưa vào đăng ký, lưu ký tập trung tại trung tâm lưu ký chứng khoán thì chúng sẽ được phép giao dịch trên thị trường chứng khoán.