Phân loại virus là quá trình đặt tên virus và đặt chúng vào một hệ thống phân loại, tương tự như các hệ thống phân loại được sử dụng cho các sinh vật tế bào. Virus chủ yếu được phân loại theo các đặc điểm kiểu hình, chẳng hạn như hình thái, loại axit nucleic, chế độ sao chép, sinh vật chủ và loại bệnh mà chúng gây ra. Việc phân loại virus chính thức là trách nhiệm của Ủy ban quốc tế về phân loại virus (ICTV), mặc dù hệ thống phân loại của Baltimore có thể được sử dụng để đặt virus vào một trong bảy nhóm dựa trên cách tổng hợp mRNA của chúng. Các quy ước đặt tên cụ thể và các hướng dẫn phân loại tiếp theo được ICTV đặt ra. Một danh mục của tất cả các loại virus được biết đến trên thế giới đã được đề xuất và vào năm 2013, một số nỗ lực sơ bộ đã được tiến hành. Hệ thống phân loại virus đã được sắp xếp lại và theo phân loại mới nhất, các virus được phân thành 6 bộ chính :
Caudovirales: Bao gồm các virus có ADN và có cấu trúc hình que (như virus phages). Herpesvirales: Bao gồm các virus herpesvirus có ADN gây bệnh ở động vật và con người. Mononegavirales: Bao gồm các virus RNA đơn sợi âm quang, bao gồm các loại virus gây bệnh như virus Ebola và virus Cúm. Nidovirales: Bao gồm các virus RNA dương sợi lớn, bao gồm các loại virus gây bệnh như virus SARS-CoV-2 (virus gây COVID-19). Picornavirales: Bao gồm các virus RNA dương sợi nhỏ, không bao bọc, bao gồm các loại virus gây bệnh như virus Poliovirus và virus Feline Calicivirus (FCV). Tymovirales: Bao gồm các virus RNA dương sợi nhỏ, không bao bọc, gây bệnh ở cây trồng.