Pectinesterase (PE) (EC 3.1.1.11) là một loại enzyme có liên quan đến thành tế bào và có ở khắp mọi nơi. Chúng có chứa một số đồng dạng (isoform) giúp tạo điều kiện cho sự thay đổi của thành tế bào thực vật và sau này là phân hủy chúng. Enzyme này được tìm thấy trong tất cả các loài thực vật bậc cao nhưng cũng có trong một số vi khuẩn và nấm. Pectinesterase hoạt động chủ yếu bằng cách thay đổi độ pH cục bộ của thành tế bào từ đó làm thay đổi tính toàn vẹn của thành tế bào. Pectinesterase xúc tác quá trình hủy este hóa pectin thành pectat và metanol. Pectin là một trong những thành phần chính của thành tế bào thực vật. Ở thực vật, pectinesterase đóng một vai trò quan trọng trong quá trình chuyển hóa thành tế bào, chẳng hạn trong quá trình chín của quả. Ở các mầm bệnh gây hại thực vật như vi khuẩn Erwinia carotovora hay như nấm Aspergillus niger, pectinesterase có liên quan đến phá vỡ kết cấu và "làm mềm" các mô của thực vật. Pectinesterase ở thực vật cơ thể được điều chỉnh bởi các chất ức chế pectinesterase, song chúng không hiệu quả đối với các enzyme của vi sinh vật.