Ohta Tomoko (tên trong tiếng Nhật: 太田 朋子, tiếng Anh: /tumoʊkoʊ ˈoʊtə/, tiếng Việt: /ô-ta tô-mô-cô/) là nhà nữ khoa học Nhật Bản chuyên về lĩnh vực di truyền phân tử và tiến hoá phân tử. Bà nổi tiếng vì những thành tựu nghiên cứu của mình trong lĩnh vực đa hình di truyền, nhất là cống hiến về phát triển thuyết tiến hoá trung tính bằng học thuyết gọi là thuyết tiến hoá phân tử gần trung tính (the nearly neutral theory of molecular evolution)., Thuyết tiến hóa phân tử gần trung tính là một mở rộng thuyết tiến hoá trung tính mà Kimura Motoo đề xuất về tiến hóa phân tử.,