Vi nấm là vi sinh vật thuộc giới Nấm, sinh sản bằng nhiều hình thức (vô tính hoặc lưỡng tính): sợi, bào tử và có thành tế bào chứa chitin (kitin), một loại polymer nhóm N-acetylglucosamine. Về mặt phân loại học, vi nấm là một nhóm do con người đặt ra và một nhóm phân loại cận ngành. Điểm khác biệt duy nhất của vi nấm với nấm thông thường là chúng không có cơ thể quá lớn, cấu tạo đa bào. Vi nấm có mặt khắp mọi nơi, cả ở môi trường trên cạn và dưới nước, và thường tìm thấy trên thực vật, đất, nước, côn trùng, gia súc, tóc và da.
Cơ thể của vi nấm thường gồm những sợi kéo dài, gọi là sợi nấm (hyphae), lan ra trên bề mặt mà chúng bám vào. Thể sợi tạo ra các bào tử, được phát tán nhờ gió, lây lan nấm ra các bề mặt, sinh vật khác
Nhiều loại vi nấm là có lợi, chẳng hạn như làm sinh vật phân giải trong đất, phần lớn không thể nhìn thấy bằng mắt thường. Hàng ngàn loài vi nấm được tìm thấy trong địa y, một dạng cộng sinh giữa nấm và tảo. Tuy nhiên cũng có một số loài nấm có hại, chẳng hạn như Penicillium, Aspergillus và Neurospora được phát hiện là những loại nấm mốc làm hỏng trái cây và bánh mì.
Một số loài vi nấm còn có giá trị thương mại. Các chủng nấm Penicillium được sử dụng trong sản xuất pho mát xanh và là nguồn gốc của kháng sinh nổi tiếng penicillin, được phát hiện bởi Alexander Fleming vào năm 1928. Một loại vi nấm khác là Fusarium venenatum được sử dụng để sản xuất thịt nhân tạo có chứa protein đơn bào (những sản phẩm có chứa protein có nguồn gốc từ nấm còn được gọi là mycoprotein).