Bảo tàng Alexandre Yersin (hay Bảo tàng Yersin) là một bảo tàng ở Nha Trang, Việt Nam. Đây nơi lưu trữ nhiều kỷ vật của bác sĩ Alexandre Yersin, một bác sĩ y khoa, nhà vi khuẩn học, và nhà thám hiểm người Pháp gốc Thụy Sĩ. Bảo tàng được thành lập năm 1997, nằm trong khuôn viên Viện Pasteur Nha Trang.